本刊创刊于1983年，是安徽工程科技学院主办的以机械工程、材料工程、电气工程、电子技术、自动化技术、计算机工程、信息技术、化学工程、食品工程、纺织工程和生物工程为主，兼顾经济管理以及其它相关学科的理工类综合性学术期刊。《安徽工程科技学院学报》(自然科学版)是2002年由《安徽机电学院学报》更名而来的，主要读者对象为高等院校师生员工及有关科研院所、企事业单位的科研、科技工作者。本刊为季刊，国内外公开发行。国际标准刊号：ISSN1007-5240，国内统一刊号：CN34-1160/TH。学报与国内600余所高校进行交流，已被中国学术期刊（光盘版）和“万方数据——数字化期刊群”收录。《安徽工程科技学院学报》1998年被评为安徽省优秀科技期刊，1999年被评为安徽省优秀高校学报，2000年参加中国学术期刊光盘版评比获优秀奖。从2000年开始，被美国《化学文摘》、俄罗斯《文摘杂志》收录。